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# 中可用的 Ready2Run 工作流程 HealthOmics
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下表列出了中可用的 Ready2Run 工作流程。 HealthOmics

您可以登录[HealthOmics控制台](https://console.aws.amazon.com/omics/home#/ready2run)查看有关这些工作流程的详细信息，包括输入参数和工作流程图。[有关 Ready2Run 工作流程的定价信息，请参阅定价。HealthOmics ](https://aws.amazon.com/healthomics/pricing/)

**注意**  
每个 Ready2Run 工作流程都有最大输入文件大小。这些最大文件大小不可调整。


| 工作流名称 | 发布者 | 需要订阅？ | 最大输入文件大小 (GiB) | 预计运行时间 (HH: MM) | 
| --- | --- | --- | --- | --- | 
| AlphaFold 用于 601-1200 残留物 | 谷歌 DeepMind | 否 | 1 | 11:15 | 
| AlphaFold 最多可容纳 600 个残留物  | 谷歌 DeepMind | 否 | 1 | 7:30 | 
| 适用于 2x150 的 Bases2Fastq  | 元素生物科学 | 否 | 1000 | 1:45 | 
| 适用于 2x300 的 Bases2Fastq  | 元素生物科学 | 否 | 1000 | 1:30 | 
| 适用于 2x75 的 Bases2Fastq  | 元素生物科学 | 否 | 500 | 0:45 | 
| ESMFold 最多可容纳 800 个残留物  | 元研究 | 否 | 1 | 0:15 | 
| GATK-BP fq2bam  | 布罗德研究所 | 否 | 64 | 10:10 | 
| GATK-BP Germline bam2vcf 用于 30 倍基因组  | 布罗德研究所 | 否 | 39 | 2:45 | 
| GATK-BP Germline fq2vcf 用于 30 倍基因组  | 布罗德研究所 | 否 | 64 | 12:30 | 
| GATK-BP Somatic WES bam2vcf  | 布罗德研究所 | 否 | 86 | 1:30 | 
| NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS 最高可达 30 倍  | 英伟达公司 | 否 | 80 | 1:39 | 
| NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS 最高可达 50 倍  | 英伟达公司 | 否 | 120 | 2:45 | 
| NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS 最高可达 5 倍  | 英伟达公司 | 否 | 20 | 0:18 | 
| NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS 最高可达 30 倍  | 英伟达公司 | 否 | 71 | 1:00 | 
| NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS 最高可达 50 倍  | 英伟达公司 | 否 | 137 | 1:45 | 
| NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS 最高可达 5 倍  | 英伟达公司 | 否 | 13 | 0:15 | 
| NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 最高可达 30 倍  | 英伟达公司 | 否 | 71 | 2:00 | 
| NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 最高可达 50 倍  | 英伟达公司 | 否 | 137 | 3:30 | 
| NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 售价高达 5 倍  | 英伟达公司 | 否 | 12 | 0:30 | 
| NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最高可达 30 倍  | 英伟达公司 | 否 | 71 | 1:15 | 
| NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最高可达 50 倍  | 英伟达公司 | 否 | 137 | 2:00 | 
| NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 售价高达 5 倍  | 英伟达公司 | 否 | 13 | 0:15 | 
| NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS 最高可达 50 倍  | 英伟达公司 | 否 | 196 | 0:45 | 
| sc wit RNAseq h Kallisto BUStools  | NF-Core | 否 | 119 | 1:30 | 
| sc RNAseq 配三文鱼 Alevin-fry  | NF-Core | 否 | 119 | 2:30 | 
| sc w RNAseq ith STARsolo  | NF-Core | 否 | 119 | 2:30 | 
| Sentieon Germline BAM WES 最高可达 300 倍  | Sentieon, Inc. | 是 | 9 | 1:00 | 
| Sentieon Germline BAM WGS 最高可达 32 倍  | Sentieon, Inc. | 是 | 18 | 1:30 | 
| Sentieon Germline FASTQ WES 最高可达 100 倍  | Sentieon, Inc. | 是 | 5 | 0:45 | 
| Sentieon Germline FASTQ WES 最高可达 300 倍  | Sentieon, Inc. | 是 | 26 | 2:00 | 
| Sentieon Germline FASTQ WGS 最高可达 32 倍  | Sentieon, Inc. | 是 | 51 | 3:30 | 
| 安大略省的 Sentieon LongRead  | Sentieon, Inc. | 是 | 25 | 1:30 | 
| Sentieon for LongRead PacBio HiFi  | Sentieon, Inc. | 是 | 58 | 4:00 | 
| Sentieon Somatic WES  | Sentieon, Inc. | 是 | 50 | 2:30 | 
| Sentieon Somatic WGS  | Sentieon, Inc. | 是 | 113 | 4:30 | 
| Ultima Genomic DeepVariant s 最高可达 40 倍  | Ultima Genomics | 否 | 91 | 1:55 | 

当您使用 Ready2Run 工作流程时，您的工作流程是预先配置的，无法编辑。与私有工作流程相比，Ready2Run 工作流程不支持以下内容：
+ 增加最大输入文件大小
+ 更改计算资源或运行存储 
+ 更改工作流程定义或容器
+ 向跑步组中添加跑步
+ 共享工作流程

如果发布者已共享了 Ready2Run 工作流程 GitHub，则可以基于 Ready2Run 工作流程创建自己的私有工作流程。下表提供了每个发布者 GitHub 的工作流程链接。


| 发布者 | 工作流程已开启 GitHub | 
| --- | --- | 
| 谷歌 DeepMind、元研究 | [蛋白质折叠工作流程](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/protein-folding/workflows) | 
| 元素生物科学 | 如需信息，请联系元素生物科学 | 
| 布罗德研究所 | [GATK 工作流程](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/gatk-best-practices/workflows) | 
| 英伟达公司 | [Parabricks 工作流程](https://github.com/clara-parabricks-workflows/parabricks-omics-private-workflows) | 
| nf-core | [NF 核心工作流程](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/nf-core/workflows/scrnaseq) | 
| Sentieon | [Sentieon 工作流程](https://github.com/Sentieon/sentieon-amazon-omics) | 
| Ultima Genomics | [Ultima Genomics 工作流程](https://github.com/Ultimagen/healthomics-workflows) |