As traduções são geradas por tradução automática. Em caso de conflito entre o conteúdo da tradução e da versão original em inglês, a versão em inglês prevalecerá. # Fluxos de trabalho Ready2Run disponíveis em HealthOmics A tabela a seguir lista os fluxos de trabalho do Ready2Run que estão disponíveis em. HealthOmics Você pode fazer login no [HealthOmicsconsole](https://console.aws.amazon.com/omics/home#/ready2run) para ver informações detalhadas sobre esses fluxos de trabalho, incluindo parâmetros de entrada e diagramas de fluxo de trabalho. [Para obter informações sobre preços dos fluxos de trabalho do Ready2Run, consulte Preços. HealthOmics ](https://aws.amazon.com/healthomics/pricing/) **nota** Cada fluxo de trabalho do Ready2Run tem um tamanho máximo de arquivo de entrada. Esses tamanhos máximos de arquivo não são ajustáveis. | Nome do fluxo de trabalho | Publicador | É necessária uma assinatura? | Tamanho máximo do arquivo de entrada (GiB) | Tempo de execução estimado (HH:MM) | | --- | --- | --- | --- | --- | | AlphaFold para 601-1200 resíduos | Google DeepMind | Não | 1 | 11:15 | | AlphaFold para até 600 resíduos | Google DeepMind | Não | 1 | 7:30 | | Bases2Fastq para 2x150 | Biociências do Elemento | Não | 1000 | 1:45 | | Bases2Fastq para 2x300 | Biociências do Elemento | Não | 1000 | 1:30 | | Bases2Fastq para 2x75 | Biociências do Elemento | Não | 500 | 0:45 | | ESMFold para até 800 resíduos | Metapesquisa | Não | 1 | 0:15 | | GATK-BP fq2bam | Instituto Broad | Não | 64 | 10 & 10 | | Linha germinativa GATK-BP bam2vcf para genoma 30x | Instituto Broad | Não | 39 | 2:45 | | Linha germinativa GATK-BP fq2vcf para genoma 30x | Instituto Broad | Não | 64 | 12:30 | | GATK-BP Somatic WES bam2vcf | Instituto Broad | Não | 86 | 1:30 | | NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS para até 30X | Corporação NVIDIA | Não | 80 | 1:39 | | NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS para até 50X | Corporação NVIDIA | Não | 120 | 2:45 | | NVIDIA Parabricks BAM2 FQ2 BAM WGS para até 5X | Corporação NVIDIA | Não | 20 | 0:18 | | NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS para até 30X | Corporação NVIDIA | Não | 71 | 1:00 | | NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS para até 50X | Corporação NVIDIA | Não | 137 | 1:45 | | NVIDIA Parabricks FQ2 BAM WGS para até 5X | Corporação NVIDIA | Não | 13 | 0:15 | | NVIDIA Parabricks DeepVariant Germline WGS para até 30X | Corporação NVIDIA | Não | 71 | 2:00 | | NVIDIA Parabricks DeepVariant Germline WGS para até 50X | Corporação NVIDIA | Não | 137 | 3:30 | | NVIDIA Parabricks DeepVariant Germline WGS para até 5X | Corporação NVIDIA | Não | 12 | 0:30 | | NVIDIA Parabricks HaplotypeCaller Germline WGS para até 30X | Corporação NVIDIA | Não | 71 | 1:15 | | NVIDIA Parabricks HaplotypeCaller Germline WGS para até 50X | Corporação NVIDIA | Não | 137 | 2:00 | | NVIDIA Parabricks HaplotypeCaller Germline WGS para até 5X | Corporação NVIDIA | Não | 13 | 0:15 | | NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS para até 50X | Corporação NVIDIA | Não | 196 | 0:45 | | sc RNAseq com Kallisto BUStools | NF-núcleo | Não | 119 | 1:30 | | 1 colher de RNAseq chá com salmão frito | NF-núcleo | Não | 119 | 2:30 | | sc RNAseq com STARsolo | NF-núcleo | Não | 119 | 2:30 | | Sentieon Germline BAM WES para até 300x | Sentieon, Inc. | Sim | 9 | 1:00 | | Sentieon Germline BAM WGS para até 32x | Sentieon, Inc. | Sim | 18 | 1:30 | | Sentieon Germline FASTQ WES por até 100x | Sentieon, Inc. | Sim | 5 | 0:45 | | Sentieon Germline FASTQ WES por até 300x | Sentieon, Inc. | Sim | 26 | 2:00 | | Sentieon Germline FASTQ WGS por até 32x | Sentieon, Inc. | Sim | 51 | 3:30 | | Sentieon LongRead para ONT | Sentieon, Inc. | Sim | 25 | 1:30 | | Sentieon LongRead para PacBio HiFi | Sentieon, Inc. | Sim | 58 | 4:00 | | Sentieon Somatic WES | Sentieon, Inc. | Sim | 50 | 2:30 | | Sentieon Somatic WGS | Sentieon, Inc. | Sim | 113 | 4:30 | | Ultima Genomics DeepVariant para até 40x | Ultima Genomics | Não | 91 | 1:55 | Quando você usa um fluxo de trabalho Ready2Run, seu fluxo de trabalho é pré-configurado e não pode ser editado. Ao contrário dos fluxos de trabalho privados, os fluxos de trabalho do Ready2Run não oferecem suporte ao seguinte: + Aumentar o tamanho máximo do arquivo de entrada + Alterar os recursos computacionais ou executar o armazenamento + Alterando a definição do fluxo de trabalho ou os contêineres + Adicionar execuções a um grupo de corridas + Compartilhando o fluxo de trabalho Se o editor tiver compartilhado o fluxo de trabalho do Ready2Run GitHub, você poderá criar seu próprio fluxo de trabalho privado com base no fluxo de trabalho do Ready2Run. A tabela a seguir fornece links para GitHub fluxos de trabalho de cada editor. | Publicador | Fluxos de trabalho em GitHub | | --- | --- | | Google DeepMind, Meta Pesquisa | [Fluxos de trabalho para dobrar proteínas](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/protein-folding/workflows) | | Biociências do Elemento | Para obter informações, entre em contato com a Element Biosciences | | Instituto Broad | [Fluxos de trabalho do GATK](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/gatk-best-practices/workflows) | | Corporação NVIDIA | [Fluxos de trabalho do Parabricks](https://github.com/clara-parabricks-workflows/parabricks-omics-private-workflows) | | nf-core | [Fluxos de trabalho NF-Core](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/nf-core/workflows/scrnaseq) | | Sentieon | [Fluxos de trabalho do Sentieon](https://github.com/Sentieon/sentieon-amazon-omics) | | Ultima Genomics | [Fluxos de trabalho da Ultima Genomics](https://github.com/Ultimagen/healthomics-workflows) |