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# HealthOmics에서 사용 가능한 Ready2Run 워크플로
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다음 표에는 HealthOmics에서 사용할 수 있는 Ready2Run 워크플로가 나열되어 있습니다.

[HealthOmics 콘솔](https://console.aws.amazon.com/omics/home#/ready2run)에 로그인하여 입력 파라미터 및 워크플로 다이어그램을 포함하여 이러한 워크플로에 대한 자세한 정보를 볼 수 있습니다. Ready2Run 워크플로에 대한 요금 정보는 [HealthOmics 요금을](https://aws.amazon.com/healthomics/pricing/) 참조하세요.

**참고**  
각 Ready2Run 워크플로에는 최대 입력 파일 크기가 있습니다. 이러한 최대 파일 크기는 조정할 수 없습니다.


| 워크플로 이름 | 게시자  | 구독이 필요합니까? | 최대 입력 파일 크기(GiB) | 예상 런타임(HH:MM) | 
| --- | --- | --- | --- | --- | 
| AlphaFold - 601-1200개 구체화 | Google DeepMind | 아니요 | 1 | 11:15 | 
| 최대 600개의 시크릿에 대한 AlphaFold  | Google DeepMind | 아니요 | 1 | 7:30 | 
| 2x150용 Bases2Fastq  | Element Biosciences | 아니요 | 1000 | 1:45 | 
| 2x300용 Bases2Fastq  | Element Biosciences | 아니요 | 1000 | 1:30 | 
| 2x75용 Bases2Fastq  | Element Biosciences | 아니요 | 500 | 0:45 | 
| 최대 800개의 시크릿에 대한 ESMFold  | 메타 연구 | 아니요 | 1 | 0:15 | 
| GATK-BP fq2bam  | 브로드 인스티튜트 | 아니요 | 64 | 10:10 | 
| 30x 유전체용 GATK-BP Germline bam2vcf  | 브로드 인스티튜트 | 아니요 | 39 | 2:45 | 
| 30x 유전체용 GATK-BP Germline fq2vcf  | 브로드 인스티튜트 | 아니요 | 64 | 12:30 | 
| GATK-BP 신체 WES bam2vcf  | 브로드 인스티튜트 | 아니요 | 86 | 1:30 | 
| 최대 30X의 NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 80 | 1:39 | 
| 최대 50X의 NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 120 | 2:45 | 
| 최대 5X의 NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 20 | 0:18 | 
| 최대 30X의 NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 71 | 1:00 | 
| 최대 50X의 NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 137 | 1:45 | 
| 최대 5X의 NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 13 | 0:15 | 
| 최대 30X의 NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 71 | 2:00 | 
| 최대 50X의 NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 137 | 3:30 | 
| 최대 5X의 NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 12 | 0:30 | 
| 최대 30X의 NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 71 | 1:15 | 
| 최대 50X의 NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 137 | 2:00 | 
| 최대 5X의 NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 13 | 0:15 | 
| 최대 50X의 NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS  | NVIDIA Corporation | 아니요 | 196 | 0:45 | 
| KallistoBUStools를 사용하는 scRNAseq  | NF-Core | 아니요 | 119 | 1:30 | 
| Salmon Alevin-fry를 사용한 scRNAseq  | NF-Core | 아니요 | 119 | 2:30 | 
| STARsolo를 사용하는 scRNAseq  | NF-Core | 아니요 | 119 | 2:30 | 
| 최대 300배의 Sentieon Germline BAM WES  | Sentieon, Inc. | 예 | 9 | 1:00 | 
| 최대 32배의 Sentieon Germline BAM WGS  | Sentieon, Inc. | 예 | 18 | 1:30 | 
| 최대 100배의 Sentieon Germline FASTQ WES  | Sentieon, Inc. | 예 | 5 | 0:45 | 
| 최대 300배의 Sentieon Germline FASTQ WES  | Sentieon, Inc. | 예 | 26 | 2:00 | 
| 최대 32배의 Sentieon Germline FASTQ WGS  | Sentieon, Inc. | 예 | 51 | 3:30 | 
| ONT용 Sentieon LongRead  | Sentieon, Inc. | 예 | 25 | 1:30 | 
| PacBio HiFi용 Sentieon LongRead  | Sentieon, Inc. | 예 | 58 | 4:00 | 
| Sentieon 신체 WES  | Sentieon, Inc. | 예 | 50 | 2:30 | 
| Sentieon Somatic WGS  | Sentieon, Inc. | 예 | 113 | 4:30 | 
| 최대 40배의 Ultima Genomics DeepVariant  | Ultima Genomics | 아니요 | 91 | 1:55 | 

Ready2Run 워크플로를 사용하면 워크플로가 미리 구성되어 편집할 수 없습니다. 프라이빗 워크플로와 달리 Ready2Run 워크플로는 다음을 지원하지 않습니다.
+ 최대 입력 파일 크기 늘리기
+ 컴퓨팅 리소스 변경 또는 스토리지 실행 
+ 워크플로 정의 또는 컨테이너 변경
+ 실행 그룹에 실행 추가
+ 워크플로 공유

게시자가 GitHub에서 Ready2Run 워크플로를 공유한 경우 Ready2Run 워크플로를 기반으로 자체 프라이빗 워크플로를 만들 수 있습니다. 다음 표에는 각 게시자의 GitHub 워크플로에 대한 링크가 나와 있습니다.


| 게시자  | GitHub의 워크플로 | 
| --- | --- | 
| Google DeepMind, Meta Research | [단백질 폴딩 워크플로](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/protein-folding/workflows) | 
| Element Biosciences | 자세한 내용은 Element Biosciences에 문의하세요. | 
| 브로드 인스티튜트 | [GATK 워크플로](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/gatk-best-practices/workflows) | 
| NVIDIA Corporation | [Parabricks 워크플로](https://github.com/clara-parabricks-workflows/parabricks-omics-private-workflows) | 
| nf-core | [NF-Core 워크플로](https://github.com/aws-samples/amazon-omics-tutorials/tree/main/example-workflows/nf-core/workflows/scrnaseq) | 
| 센티온 | [Sentieon 워크플로](https://github.com/Sentieon/sentieon-amazon-omics) | 
| Ultima Genomics | [Ultima Genomics 워크플로](https://github.com/Ultimagen/healthomics-workflows) |