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Requisiti di calcolo e memoria per le attività HealthOmics
HealthOmics esegue le attività private del flusso di lavoro in un'istanza omics. HealthOmics offre una varietà di tipi di istanze per soddisfare diversi tipi di attività. Ogni tipo di istanza ha una configurazione fissa di memoria e vCPU (e una configurazione GPU fissa per i tipi di istanze di elaborazione accelerata). Il costo dell'utilizzo di un'istanza omics varia a seconda del tipo di istanza. Per i dettagli, consulta la pagina HealthOmics dei prezzi
Per le attività in un flusso di lavoro, si specifica la memoria richiesta e v CPUs nel file di definizione del flusso di lavoro. Quando viene eseguita un'operazione di workflow, HealthOmics alloca l'istanza omics più piccola che contiene la memoria richiesta e v. CPUs Ad esempio, se un'attività richiede 64 GiB di memoria e 8 vCPUs, HealthOmics seleziona. omics.r.2xlarge
Ti consigliamo di esaminare i tipi di istanza e di impostare la v CPUs e la dimensione di memoria richieste in modo che corrispondano all'istanza che meglio soddisfa le tue esigenze. Il contenitore delle attività utilizza il numero di v CPUs e la dimensione della memoria specificati nel file di definizione del flusso di lavoro, anche se il tipo di istanza dispone di v CPUs e memoria aggiuntivi.
L'elenco seguente contiene informazioni aggiuntive su vCPU e allocazione della memoria:
Le allocazioni di risorse dei container sono limiti rigidi. Se un'attività esaurisce la memoria o tenta di utilizzare v aggiuntiviCPUs , l'attività genera un registro degli errori e viene chiusa.
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Se non specifichi alcun requisito di calcolo o memoria, HealthOmics seleziona omics.c.large e imposta di default una configurazione con 1 vCPU e 1 GiB di memoria.
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La configurazione minima che è possibile richiedere è 1 vCPU e 1 GiB di memoria.
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Se si specifica vCPUs, memory o GPUs che supera i tipi di istanza supportati, viene generato un messaggio di errore e il HealthOmics flusso di lavoro non viene convalidato
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Se specificate unità frazionarie, HealthOmics arrotondate al numero intero più vicino.
HealthOmics riserva una piccola quantità di memoria (5%) per gli agenti di gestione e registrazione, pertanto l'allocazione completa della memoria potrebbe non essere sempre disponibile per l'applicazione coinvolta nell'operazione.
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HealthOmics corrisponde ai tipi di istanza per soddisfare i requisiti di calcolo e memoria specificati e può utilizzare una combinazione di generazioni hardware. Per questo motivo, possono verificarsi alcune lievi variazioni nei tempi di esecuzione delle attività per la stessa attività.
Questi argomenti forniscono dettagli sui tipi di istanze HealthOmics supportati.
Argomenti
Nota
Per le istanze standard, di calcolo e ottimizzate per la memoria, aumenta la dimensione della larghezza di banda dell'istanza se l'istanza richiede un throughput più elevato. Le istanze Amazon EC2 con meno di 16 vCPU (dimensioni 4xl e inferiori) possono subire un aumento del throughput. Per ulteriori informazioni sulla velocità effettiva delle istanze Amazon EC2, consulta Larghezza di banda disponibile delle istanze di Amazon EC2.
Tipi di istanze standard
Per i tipi di istanze standard, le configurazioni mirano a un equilibrio tra potenza di calcolo e memoria.
HealthOmics supporta le istanze 32xlarge e 48xlarge in queste regioni: Stati Uniti occidentali (Oregon) e Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale).
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria |
|---|---|---|
| omics.m.large | 2 | 8 GiB |
| omics.m.xlarge | 4 | 16 GiB |
| omics.m.2xlarge | 8 | 32 GiB |
| omics.m.4xlarge | 16 | 64 GiB |
| omics.m.8xlarge | 32 | 128 GiB |
| omics.m.12xlarge | 48 | 192 GiB |
| omics.m.16xlarge | 64 | 256 GiB |
| omics.m.24xlarge | 96 | 384 GiB |
| omics.m.32xlarge | 128 | 512 GiB |
| omics.m.48xlarge | 192 | 768 GiB |
Istanze ottimizzate per il calcolo
Per i tipi di istanza ottimizzati per l'elaborazione, le configurazioni offrono maggiore potenza di calcolo e meno memoria.
HealthOmics supporta le istanze 32xlarge e 48xlarge in queste regioni: Stati Uniti occidentali (Oregon) e Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale).
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria |
|---|---|---|
| omics.c.large | 2 | 4 GiB |
| omics.c.xlarge | 4 | 8 GiB |
| omics.c.2xlarge | 8 | 16 GiB |
| omics.c.4xlarge | 16 | 32 GiB |
| omics.c.8xlarge | 32 | 64 GiB |
| omics.c.12xlarge | 48 | 96 GiB |
| omics.c. 16 x large | 64 | 128 GiB |
| omics.c.24xlarge | 96 | 192 GiB |
| omics.c.32xlarge | 128 | 256 GiB |
| omics.c.48xlarge | 192 | 384 GiB |
Istanze ottimizzate per la memoria
Per i tipi di istanza ottimizzati per la memoria, le configurazioni hanno meno potenza di calcolo e più memoria.
HealthOmics supporta le istanze 32xlarge e 48xlarge in queste regioni: Stati Uniti occidentali (Oregon) e Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale).
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria |
|---|---|---|
| omic s.r.large | 2 | 16 GiB |
| omic s.r.xlarge | 4 | 32 GiB |
| omic s.r.2xlarge | 8 | 64 GiB |
| omic s.r.4 x grande | 16 | 128 GiB |
| omic s.r.8xlarge | 32 | 256 GiB |
| omic s.r.12 x grande | 48 | 384 GiB |
| omics.r. 16 x grande | 64 | 512 GiB |
| omic s.r.24xlarge | 96 | 768 GiB |
| omic s.r.32xlarge | 128 | 1024 GiB |
| Fomics.r. 48 x grande | 192 | 1536 GiB |
Istanze di elaborazione accelerata
Facoltativamente, è possibile specificare risorse GPU per ogni attività in un flusso di lavoro, in modo da HealthOmics allocare un'istanza di elaborazione accelerata per l'attività. Per informazioni su come specificare le informazioni sulla GPU nel file di definizione del flusso di lavoro, vedere. Acceleratori di attività in una definizione di workflow HealthOmics
Se si specifica un acceleratore di attività che supporta più tipi di istanza, HealthOmics seleziona il tipo di istanza in base alla disponibilità. Se sono disponibili più tipi di istanza, HealthOmics dà la preferenza all'istanza a basso costo. L'eccezione è rappresentata dal task accelerator nvidia-t4-a10g-l4 che dà la preferenza all'istanza di ultima generazione disponibile nella tua regione.
Le istanze G4 non sono supportate nella regione di Israele (Tel Aviv). Le istanze G5 non sono supportate nella regione Asia Pacifico (Singapore).
Tipi di istanze G6 e G6e
HealthOmics supporta le seguenti configurazioni di istanza di calcolo accelerato G6. Tutte le istanze omics.g6 utilizzano Nvidia L4. GPUs
HealthOmics supporta le istanze G6 e G6e in queste regioni: Stati Uniti occidentali (Oregon) e Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale).
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria | Numero di GPUs | Memoria GPU |
|---|---|---|---|---|
| omics.g6.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.4xlarge | 16 | 64 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.8xlarge | 32 | 128 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 96 GiB |
| omics.g6.16xlarge | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.24xlarge | 96 | 384 GiB | 4 | 96 GiB |
Tutte le istanze omics.g6e utilizzano Nvidia L40s. GPUs
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria | Numero di GPUs | Memoria GPU |
|---|---|---|---|---|
| omics.g6e.xlarge | 4 | 32 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.2xlarge | 8 | 64 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.4xlarge | 16 | 128 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.8xlarge | 32 | 256 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.12xlarge | 48 | 384 GiB | 4 | 192 GiB |
| omics.g6e.16xlarge | 64 | 512 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.24xlarge | 96 | 768 GiB | 4 | 192 GiB |
Istanze G4 e G5
HealthOmics supporta le seguenti configurazioni di istanze di calcolo accelerato G4 e G5.
Tutte le istanze omics.g5 utilizzano Nvidia Tesla A10G. GPUs
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria | Numero di GPUs | Memoria GPU |
|---|---|---|---|---|
| omics.g5.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.4xlarge | 16 | 64 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.8xlarge | 32 | 128 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 96 GiB |
| omics.g5.16xlarge | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.24xlarge | 96 | 384 GiB | 4 | 96 GiB |
Tutte le istanze omics.g4dn utilizzano Nvidia Tesla T4. GPUs
| Istanza | Numero di v CPUs | Memoria | Numero di GPUs | Memoria GPU |
|---|---|---|---|---|
| omics.g4dn.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.4xlarge | 16 | 64 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.8xlarge | 32 | 128 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 64 GiB |
| omics.g4dn.16xlarge | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
